BehaviorAtlas MultiBehavior · 软件系列

多行为分析软件系列

面向单只动物的多行为精细量化 — 无标记 3D 捕捉、有监督行为识别与模型驱动行为谱分析,配备专用硬件、软件及配套算法,支持单只小鼠与单只猪。

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分析对象

基于统一的多行为分析方法论,针对单只小鼠与单只猪分别配置专用硬件、软件平台及配套算法体系 — 选择分析对象查看对应技术方案。

软件功能

BehaviorAtlas Capture 与 BehaviorScope 功能体系 — 覆盖多相机同步采集、TTL 事件同步、场景标定,以及工程管理、三维重建、有监督行为识别与结果导出;单只小鼠与单只猪按模型配置灵活适配。

采集软件

多相机同步采集

支持多路可见光相机同步录制,一键启动实验采集,保障多视角原始视频时间对齐,适配单只小鼠 4–6 路与单只猪九视角等配置。

采集软件

TTL 事件同步

支持 TTL 事件标记与外部设备同步触发,将行为事件时间戳与多机位视频精确对齐,便于后续分析与事件关联。

采集软件

适应期结束自动录制

软件支持设置小鼠适应时间,适应期结束后自动开始多相机同步录制,减少人工值守与操作延迟。

采集软件

实验录制与元数据

支持实验信息、样本命名与录制参数配置,规范化写入工程 data 目录,为后续追踪、重建与行为分析提供完整原始数据基础。

采集软件

多相机标定

Checkerboard 标定获取相机内外参数,对齐多机位坐标系并绑定行为事件时间戳,保障三维重建与多视角融合精度。

分析软件

有监督行为识别

基于预训练模型与有监督聚类,按模型配置自动识别与量化多类行为模块,输出 Supervised_paras 行为片段与标签数据,支撑单只动物多行为精细分析。

分析软件

3D 骨架重建

融合多视角 2D 追踪数据与相机标定参数,重建逐帧三维多身体骨架序列,输出 csv、c3d 等格式三维坐标,为行为识别提供高质量输入。

分析软件

内置默认模型

软件内置标准身体点追踪与行为识别默认模型;按标准化实验流程完成采集与分析,一般情况下无需额外标注训练或制作自定义模型。

分析软件

工程与数据管理

支持新建与管理分析工程,规范化目录结构:data(视频、2D 身体点、标定文件)、3Dskeleton、BeAOutputs、results_export,便于样本追踪与结果复现。

分析软件

2D 关键点追踪

预训练神经网络在单视角视频中自动识别并追踪多个身体关键点,输出逐帧 2D 坐标轨迹,作为三维重建的基础数据。

分析软件

运动学参数计算

基于三维骨架与行为序列,自动计算逐帧参数(FrameLevel_paras)与高阶运动学参数(AdvancedParameters),支撑定量行为评估。

分析软件

同步回放与质控

多机位原始视频与三维骨架重建结果同步对照,逐帧审查关键点追踪与重建效果,快速发现遮挡、丢点与标定偏差。

分析软件

可视化与结果导出

提供行为谱、时序分布、占比统计与组间对比等可视化,支持将表格、图片与视频一键导出至 results_export 目录。

软件矩阵

Capture · BehaviorScope — 采集与数据分析可视化两大核心软件,选择分析对象查看专属方案。

BehaviorAtlas Capture · 单只小鼠
采集

4–6 路

相机同步

50×50

cm 活动空间

多路可见光相机同步录制,TTL 事件同步与场景标定,一键启动实验录制。

BehaviorAtlas Capture · 单只小鼠

多相机同步采集软件

BehaviorAtlas BehaviorScope · 单只小鼠
分析

16+

身体关键点

有监督

行为识别

AI 自动识别身体关键点,重建 3D 骨骼序列,基于有监督聚类构建模型驱动的行为谱;提供行为谱、时序分布与统计图表等多维可视化,一键导出分析结果。

BehaviorAtlas BehaviorScope · 单只小鼠

数据分析与可视化软件

分析流程

单只小鼠多行为分析路线图 — 从标定采集到追踪测试,按效果选择批量分析或 PoseLabeler 定制模型路线。

01

相机标定

Checkerboard 标定获取各机位内外参数,对齐多相机坐标系,为三维重建提供几何基础。

相机标定
02

多相机同步采集

BehaviorAtlas Capture 多路可见光相机同步录制,TTL 事件标记与实验元数据管理。

多相机同步采集
03

样本导入分析软件

将采集视频、标定文件与实验信息导入 BehaviorScope 工程,统一管理原始数据与分析任务。

样本导入分析软件
04

追踪模型测试

在少量样本上测试预置或自定义追踪模型,检查身体关键点定位精度与稳定性,决定后续分析路线。

追踪模型测试
05

批量单视角身体点追踪

对每个单视角视频批量运行身体关键点追踪,输出高精度 2D 坐标轨迹,作为三维重建输入。

批量单视角身体点追踪
06

三维重建

多视角融合重建 3D 骨架序列,生成逐帧三维姿态数据,支撑后续行为识别与运动学分析。

三维重建
07

行为识别

使用内置或自定义行为识别模型,自动提取与量化多类行为模块,生成行为片段与标签数据。

行为识别
08

结果查看和可视化

行为模块已识别并量化,可进入行为谱、时序分布与统计图表等多维可视化与结果导出。

结果查看和可视化

行为识别效果不佳时

标注训练定制模型后,重新识别

行为标注与模型训练

在 BehaviorScope 内对行为片段进行标注,训练定制化行为识别模型,适配特定实验范式与表型。

行为标注与模型训练

追踪模型测试效果不佳时

若预置或自定义追踪模型在样本上定位不准、稳定性不足,可依次完成标注 → 训练 → 导入,再返回「追踪模型测试」重新验证。

PoseLabeler 身体点标注

使用我们提供的免费 PoseLabeler 软件进行身体关键点标注,支持高效帧级标注与质检。

PoseLabeler 身体点标注
了解 PoseLabeler

追踪模型训练

基于标注数据训练定制化身体点追踪模型,适配特定物种、视角与实验场景。

追踪模型训练

模型导入 BehaviorScope

将训练完成的追踪模型导入分析软件,返回追踪模型测试步骤,重新验证追踪效果后再进入后续流程。

模型导入 BehaviorScope

分析结果

单只小鼠 — 内置默认行为模型、逐帧质控核对、数据导出与可视化分析,支撑标准化多行为实验。

默认行为识别模型

01

默认行为识别模型

默认模型 多行为 开箱即用

内置默认行为识别模型涵盖小鼠多种常见行为,包括 moving forward、left turning、right turning、jumping、climbing、rearing、hunching、self-grooming、immobility、sniffing 等;若实验关注上述行为,可直接选用默认模型开展分析。

数据核对与逐帧质控

02

数据核对与逐帧质控

质控 逐帧 多维核对

软件支持数据核对与逐帧查看样本的运动学参数、三维重建效果、身体点追踪效果与行为识别效果,快速评估分析质量并定位异常片段。

行为数据导出

03

行为数据导出

导出 自定义 组间分析

支持将行为识别结果及相关参数导出,便于在软件内外开展自定义统计、组间对比与深度分析。

可视化分析与图表导出

04

可视化分析与图表导出

可视化 图表 导出

软件内置可视化模块,支持行为谱、时序分布、状态转换矩阵等多种图表的分析与一键导出,满足论文配图与报告需求。

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